En théorie il est bien possible de poursuivre la procédure de licenciement pour inaptitude alors que le salarié est en arrêt compte tenu des évolutions de la jurisprudence mais en pratique les employeurs sont un peu déstabilisés par le fait que l'avis a été rendu alors que le salarié est en arrêt et interrompent la procédure…Le médecin du travail précise souvent qu'il vaut mieux que l'arrêt se termine la veille de la 2ème visite médicale par exemple…Sachant qu'en cas de procédure d'inaptitude dans les suites d'un AT ou MP, le salarié est indemnisé grâce à l'indemnisation temporaire d'inaptitude…

L'arrêt maladie est souvent motivé par le fait qu'il permet une indemnisation puisqu'en cas de procédure d'inaptitude dans le cadre de la maladie ordinaire, le salarié ne perçoit pas d'indemnisation entre le 1er certificat et la fin du mois qui suit l'établissement du 2ème certificat d'inaptitude…