Merci beaucoup pour votre réponse, cela m'éclaire sur mes questions. 

Le médecin conseil accorde une invalidité 1ère catégorie : c'est ensuite le médecin du travail qui se prononce sur le temps de travail. Le médecin du travail peut parfaitement déclarer apte à temps plein un salarié placé en invalidité par le médecin conseil...

Il serait plus logique de noter dans l'avenant que le mi-temps est sur demande du médecin du travail puisque le médecin du travail a du le préciser sur le certificat d'aptitude.

J'ai repris mon activité professionnelle depuis le 5 janvier, j'ai eu ma visite médicale  de reprise avec le médecin du travail le   8 janvier, j'ai été reconnu apte et je reprends en mi temps thérapeutique qui a été demandé par le médecin conseil de plus je suis reconnus en invalidité catégorie 1. Je viens de recevoir mon avenant et on m'a mi en temps partiel choisi, je sais pas si cela est normal ? dans notre convention collective nous avons le droit de demander à travailler en temps partiel choisi mais c'est un choix venant du salarié et il faut faire une lettre en recommandé à l'employeur ensuite c'est à l’appréciation de l'employeur si cela gène pas dans le service, il accepte, pouvez-vous me donner une explication en vous remerciant par avance.